La commune de Saint-Crépin-d'Auberoche se situe à la limite du Périgord noir et du Périgord central. S'étendant sur 9,56 km², elle est traversée d'est en ouest sur environ trois kilomètre par le Manoire, un affluent de l'Isle.

La route départementale 6089 (l'ancienne route nationale 89) dessert la commune, traversant le village de Saint-Crépin-d'Auberoche qui se situe à quatorze kilomètres à l'ouest de Thenon et quinze kilomètres au sud-est de Périgueux.